制药废水的复杂性与常规生化处理工艺的高耗、低效性，是导致当前大量制药废水难以处理和不易达标排放的直接原因。因此，在采用厌氧生化处理和厌氧、好氧生化组合的传统工艺之前，对制药废水进行有效的预处理，破坏或降解其中的残留药物分子及抗生素活性，使其中难以生物降解的物质转化为易于生物降解的小分子物质，即消除其对微生物的抑制作用，提高废水的可生化性，可以使后续生物处理的难度大大减少。
药品生产过程中所用原辅料成分复杂,反应产生的废水COD高达几万mg/L,我们将称之为高浓度有机废水 ,常规方法几乎不能直接处理。常见的处理这种高浓度有机废水的方法有:溶剂萃取法、吸附法、生物法、膜分离法、氧化法、焚烧法。 化学合成制药废水生物毒性大、可生化性差，属高浓度难降解有机废水 ，通?？梢钥悸遣捎酶哐趸?铁碳微电解-ABR—UBF-好氧工艺进行处理，工程实践表明，该工艺处理效果稳定可靠，出水COD在300mg/L以下，出水水质完全达到污水综合排放标准(GB8978—1996)中二排放标准.
制药污水处理预处理材料
其中，废水氧化法是废水化学处理法的一种，是利用强氧化剂氧化分解废水中污染物，以净化废水的方法。目前废水氧化处理法已成为治理生物难降解有机有毒污染物的重要手段，在印染、化工、、造纸、电镀和印制板、制药、医院、矿山、垃圾渗滤液等废水的处理方面应用广泛。
膜生物反应器又称MBR，是一种由膜分离单元与生物处理单元相结合的新型水处理技术。在制药领域，MBR具有可使生物处理单元内生物量维持在高浓度，减少生物反应器的占地面积，使一些大分子难降解有机物的停留时间变长，有利于它们的分解；也可采用反冲洗和化学清洗减缓膜通量的下降，从而维持MBR系统的有效使用寿命。
MBR在制药废水处理中有很多优势，例如分离效率高，出水水质有保证；制药废水中含有大量悬浮物质，通过膜的分离作用，使得出水中悬浮物和浊度接近于零； 污泥浓度高，生化能力强；提高了难降解有机物的净化效率高，缩短了水力停留时间等。
虽然，采用MBR处理工艺技术可以避免传统工艺处理废水过程中含有部分残留的药物物质，抑制了微生物的生长、繁殖，造成污泥膨胀，终使生化处理失效的现象。不过，也要注意到，MBR工艺也存在膜容易被污染，运行一定时间后要对膜进行反冲洗并随着运行时间增加，反冲洗的周期不断缩短，制造成本高，能耗较高等缺陷。